肇庆城内，废立阴谋的阴云越来越浓，压得人喘不过气。
丁魁楚、陈邦傅加快了步伐，借口“天子有疾，需静养”，进一步限制了永历帝的活动，并不断将忠于皇帝的少量侍卫和内官调换。
唐王朱聿钺被秘密接入城中别院，一些趋炎附势的官员开始上表，隐隐吹风“唐王贤德”云云。山雨欲来风满楼。
然而，丁、陈的算盘打得再精，也抵不过何腾蛟那颗被“清君侧”怒火和“保社稷”忠义灼烧得滚烫的心。
瞿式耜的滴血密信，如同一道催命符，彻底点燃了何腾蛟。
几乎在接到密信的同时，他在湖广的耳目也通过其他渠道证实了废立传闻。
何腾蛟不再犹豫，他立刻以“奉密诏，入京勤王，诛杀欺君罔上、图谋废立之逆贼丁魁楚、陈邦傅”为名，在衡阳誓师，尽起麾下能战之兵两万余人，号称五万，水陆并进，顺湘江南下，直扑肇庆！
同时，他传檄广西的焦琏、以及粤北的一些尚存忠义的明军将领，要求共同起兵“清君侧”。
何腾蛟的突然起兵，打乱了丁魁楚、陈邦傅的节奏。
陈邦傅虽握有重兵，但大部分分散在广东各地镇守，且战力参差不齐，骤然要集结迎战何腾蛟这支哀兵，也有些吃力。
更重要的是，“清君侧”的大义名分在何腾蛟手中，使得陈邦傅麾下部分将领也产生了动摇。
丁魁楚惊慌失措，一面严令陈邦傅务必挡住何腾蛟，一面企图加速废立程序，造成既成事实。
就在南明内部这两股势力即将在韶关、肇庆一带撞得头破血流之际，北方，动了。
陈远在接到何腾蛟起兵的确切消息，并确认丁、陈已事实上控制永历帝、废立在即时，终于发出了酝酿已久的雷霆之令。
北京紫禁城，武英殿。
陈远一身戎装，虽未亲征，但威仪更盛。
他对着御阶下济济一堂的文武重臣，朗声道：
“南明永历，虽为朱明余绪，然其朝纲败坏，权奸当道。
今有逆臣丁魁楚、陈邦傅，欺君年幼，把持朝政，贪墨无度，更阴行废立，图谋篡逆，人神共愤！
何腾蛟虽起兵‘清君侧’，然其力弱，恐难靖乱。
我大陈，上承天命，下顺民心，既已扫清北虏，当解民倒悬，一统寰宇！”
“今南明既有君侧之奸，幼主蒙尘，朕岂能坐视？
当行汤武之事，吊民伐罪！着即发布《讨丁陈檄》，公告天下：
孤将亲遣王师，渡江南下，清君侧，诛国贼，迎还天子（永历），共安社稷！”
檄文以最快的速度传遍大江南北。
檄文中，陈远将丁魁楚、陈邦傅的罪行揭露得淋漓尽致，并巧妙地将自己打扮成“维护朱明正统、拯救幼主、铲除奸佞”的“大忠臣”形象，而将“一统天下”的真实目的，包裹在“清君侧、安社稷”的华丽外衣之下。
这对于许多仍对明朝心存一丝念想、却又对南明朝廷极度失望的士民来说，具有极大的迷惑性和吸引力。
与此同时，军事行动同步展开：
命令已在徐州一带集结的征南大将军赵勇，率八万精锐为中路主力，出凤阳，攻滁州，直逼长江北岸，目标金陵（南京）！
命令水师提督沈廷扬，率北洋水师主力并新编练的南洋水师一部，自登莱南下，汇合在崇明岛一带活动的船只，控制长江口，保障渡江，并寻机歼灭南明残存水师。
命令湖广方向的秦玉凤（已率部南下），伺机而动，若何腾蛟与丁、陈交战不利，则可“应邀”南下，以“协助何督师平乱”为名，进入湖广，实则切断何腾蛟后路，并为将来西进四川做准备。
命令柳如是的情报网络全力启动，在南明境内散布檄文，动摇其军心民心，并设法与南明朝廷中不满丁、陈的官员，以及金陵等地的守将取得秘密联系。
陈远清君侧，王旗指江南。
陈远这一手“借壳上市”玩得极为高明。
他不再以“反明逆贼”或“争霸”的面目出现，而是举起了“维护正统、铲除奸佞”的大旗，将自己置于道德的制高点和法统的延伸位置上。
这极大地减少了南征的政治阻力，混淆了敌我界限。
当赵勇的八万虎狼之师，打着“清君侧、诛丁陈”的旗号，浩浩荡荡开赴长江北岸时，整个江南，都感到了那扑面而来的、无法抗拒的巨大压力。
南明的丧钟，被这来自北方的“正义之师”，正式敲响了。