鸣人拔出了天道体内的黑棒，插在手掌里，贴身感受着对方难以言明的痛苦，他决定独自面见长门。
此时，村内的众人也通过分身蛞蝓的告知得知了战况，大家都为鸣人感到高兴并想支援他，但都被鸣人阻止了。而正在寻找佩恩本体的黑衣三人组遇见了前方的鸣人，鸣人恳请三人离开，他要独自去见佩恩本体。“太危险了。”一人劝阻道，但一旁的鹿久却同意了，他选择相信鸣人。
到达目的地前，鸣人凝聚仙术查克拉，找到了藏在假树里的小南和长门。就此，两位预言之子开始了命运的交接。
毁村杀亲的仇人就在眼前，鸣人杀意瞬间达到顶点，但他强忍了下来。趁着鸣人失神之际，长门射出黑棒，插进了鸣人体内。他本想操控鸣人，却没想到看到了鸣人的十字眼，感受到九尾那狂暴的查克拉，被吓得一阵虚脱。长门也发觉，鸣人是故意不躲开的。
鸣人此行不是来战斗的，而是来确认一些事的。可仇恨萦绕脑海，鸣人拔出黑棒，挥拳朝长门冲去，却想起如师如父的自来也曾说过的话，终究没有下狠手。两人就“和平”发表了各自的看法。作为同门弟子，鸣人也想知道长门的过去。
在鸣人出现之前，长门是不是预言之子？又或许，自从经历佩恩一战后，鸣人才正式从长门手中接下这一棒，成为真正的预言之子？
他们都为了世界和平这同一个目标：一个选择用暴力压制，让全世界屈服于他；一个选择用爱去感化，实现人人平等、安心生活。“那嘎多”和“那路多”，这两者你们更能理解谁？
随着长门娓娓道来，他的经历逐渐被鸣人了解。
儿时的他饱受战乱之苦，亲身经历双亲被木叶忍者失手错杀。尽管木叶忍者像是心虚地向长门道歉，但长门在巨大的愤怒刺激下，激活了轮回眼的能力，反杀了木叶忍者。之后，为了生存，失去双亲的长门只好一个人流浪。在当时战乱的雨隐村，没有一户人家愿意把食物给这个来路不明的孩子，哪怕长门看到他们家里食物充足。
四处漂泊的他忍受风吹雨打，在路上遇见了一只小狗，和它一起颠沛流离。而在长门饿晕之际，小南出现将他救走，辗转认识了弥彦。一场小孩的拌嘴后，三人成了好友。为了在乱世中生存，他们常干些小偷小摸的事，可即便如此，弥彦也没有沦为宵小，他有着崇高的理想——要改变世界。
没想到三人在回家的途中，莫名卷入了木叶三忍和半藏的战斗，长门的小狗不幸身亡。一向阳光的弥彦，从此一改梦想，他想成为神，改变雨隐村，甚至阻止世上一切战争。然而为了变强，他决定找木叶三忍拜师。出发前，他们把之前偷回来的食物还给了当时的当铺。虽然这段是原创剧情，但足以反映出他们做违法的事只是为了生存，内心仍是善良的。
于是三人顶着各种生命危险深入战场，最终找到了自来也。看着眼前的三个孩子，大蛇丸想杀了他们以绝后患，自来也却心生愧疚——他虽不是主战派，却确实参与了这场战争。为了弥补，自来也决定和他们一起生活，教他们一些能在乱世中存活的技巧。可命运不会让他们平静度日。
一名忍者偷偷袭击弥彦，在弥彦即将身亡的时刻，长门再次被刺激，轮回眼爆发，出手干掉了那人。赶来的自来也看到长门的眼睛，认出是轮回眼。自此他一反常态，决定教三人忍术，其实更多是想让长门控制轮回眼。可长门对自己失手杀人一事一直深感愧疚，自来也开导了他：“那不是你的错，你只是想保护同伴。”
长门解开了心结，也从自来也口中了解到成长的意义，以及有关轮回眼的往事：很久以前有一位六道仙人，他以一己之力引导世界，铸就和平盛世，而六道仙人的眼睛正是轮回眼。如今又逢乱世，仙人之眼再次出现，自来也相信长门能继承仙人的意愿，给世界带来和平。
可好景不长，陪伴三人一段时间后，自来也选择离开。三年后，为了实现和平，弥彦三人一直刻苦修炼忍术，甚至组建了一个以弥彦为首、不靠极端武力维持和平的组织。彼时恰逢岩、木、雨三国大战，雨隐村的首领半藏很快知道了这个组织。他假意接近弥彦，让弥彦出面和三国首领交涉，达成和平协议，实则偷偷勾结木叶的团藏——一个为了巩固自己在雨隐村的主权，一个为了窃取火影之位。少不更事的弥彦中了他们的陷阱：小南被半藏绑为人质，逼迫弥彦自杀。
为了救下小南，弥彦甘心死在长门手下。亲眼见好友死在自己手里，长门深受打击，愣在原地。可半藏没打算放过他们，命令手下动手。愤怒的长门再也忍不住，轮回眼全力爆发，一尊庞大的魔像出现在众人面前。彼时魔像体内没有一只尾兽，要发挥威力只能抽取施术者的查克拉。长门不顾小南的反对，强行让魔像抽取自己的查克拉，使出“幻龙九封尽”横扫全场，所过之处寸草不生。半藏看到长门的轮回眼，知道不敌，趁紫龙攻击之际，用瞬身之术逃走，现场只留下大口喘气的虚弱长门。好在长门是漩涡一族，生命力顽强，换做其他人，早就被外道魔像抽干了。
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随着弥彦死亡，长门继承他的意志，成为组织的首领。可他一改组织的行事风格，主张以暴制暴创造和平，从此这个组织便成了到处收集尾兽的恐怖暴力组织——晓。
听完长门的自述，鸣人有了自己的想法。他拿出自来也写的小说，说虽然现在痛恨长门，但愿意相信自来也，放下仇恨，实现真正的和平。
此言一出，长门嗤之以鼻，他根本不信自来也说的美好愿望，更不愿等待鸣人去实现。可听到鸣人的话，一股似曾相识的感觉涌来——他想起自己以前也曾这样说过，还为此奋斗了许久，只是遭遇变故后才放弃。如今再听这番话，长门被触动了。
他不知道的是，这些话是自来也以他为灵感创作的第一本书里主人公的自述。自来也想以此书化解人们心中的仇恨，带来和平。长门深受震撼，想起了以前的美好时光、自来也对自己的深信不疑，以及自己追求和平的初心。
看着鸣人如此坚定，长门质问他是否能坚持下去，是否会像自己一样，遭逢仇恨后放弃初心，选择用极端方式实现和平。
鸣人说，自己经历过许多痛苦：被周遭人歧视排斥，没能亲自带挚友回来，经历过失去之痛，腹内还有一只不稳定的“定时炸弹”。但他继承了自来也的意志，哪怕前方有再多苦难，都会坚持下去。
作为师兄的长门被鸣人的“嘴遁”打动，选择相信他。不顾小南的反对，使出“外道·轮回天生之术”，召唤出阎罗王，用尽全部力量复活了木叶村的所有人。至此，两位预言之子完成了命运的交接。
小南决定尊重长门的选择，带着两位挚友的遗愿退隐于雨隐村。而鸣人回村时累得快要跌倒，复活的卡卡西背起了他，接受全村人的掌声。鸣人终于成为村子的英雄，实现了儿时的愿望——得到村里人的认可。
只因带土要拿回长门的轮回眼，他找到了隐藏在雨隐村的小南。小南深知对方的目的，利用纸分身将带土引到了专属战场。她知道带土迟早会来，只是没想到这么快。带土不解：“为何长门和你会为鸣人背叛我，甚至为外人使用轮回天生之术？”
想起鸣人，小南看到了长门是如何被他一点点感动的。既然长门付出生命都选择相信鸣人，那自己也选择相信他，相信鸣人才是这个世界的光。
小南穿着晓组织的衣物，带土轻易粉碎了她的精神依赖，声称：“晓组织是我促使弥彦建立的，长门的轮回眼更是我给的，你们三人从头到尾都是我的棋子。”带土说小南太单纯，还小瞧了宇智波的写轮眼。
见带土如此挑衅，小南不再客气，直接使出“纸遁·纸舞”急速攻来，漫天纸片穿透了带土的身躯。小南深知带土的能力，想利用无数纸片抓住他的一丝破绽，可带土怎会不知？他顺势抓住藏在纸片中的小南，准备吸收她。没想到小南在自己身体的纸片里藏了一堆起爆符——她是故意被带土抓住，想拉着他一起自爆。但最后时刻，带土只把起爆符吸了进去，两人都保住了性命，却都伤势不轻：带土没了半只手，小南的查克拉也所剩无几。
见小南没了后续，带土准备“半场开香槟”，却没想到小南为他准备了一份大礼。
此时海里裂开一条巨缝，带土随即掉落下去。小南为他准备了六千亿张起爆符——小迪（迪达拉）看得眼泪都要流干了，自己拿命挣来的晓组织团费，全被小南花完了。
小南知道，带土在吸收或移动时会实体化，虚化也只能维持五分钟，于是她准备了能爆炸十分钟的起爆符。爆炸即将席卷之际，带土赶紧扯开左边的面具，露出写轮眼，使用“伊邪那岐”，颠覆了自己被炸死的结局。
小南本以为这样能解决带土，可没想到在她最放松的时候，带土从背后出现，用一根铁棍穿透了她的心脏。见小南疑惑，带土透露了更多往事：千手一族和宇智波一族本是六道仙人的血脉，各有能力；若有人能同时具备两者能力，便可使用能扭转生死的“伊邪那岐”改变战局。
小南忍痛撑着，临死之际，她依旧信任鸣人。此时，常年下雨的雨隐村迎来久违的阳光，小南沐浴在彩虹下，使出最后的力量，想为鸣人再做些事。她凝聚出一轮花圈扔向带土，被轻易避开；又扔出一个，刚刚飞出去的花圈折返回来，两轮花圈汇合引发爆炸，带土跳到空中躲开。小南再凝聚多个小花圈攻击，却被带土拿铁棍硬生生顶着杀到面前。
此时小南已无力反抗，带土一把掐住她的脖子，用幻术得知了长门的位置。小南最后的一张纸片随着大风轻轻飘落。梦回最初，师徒四人（自来也、长门、弥彦、小南）在此刻仿佛再次团聚。
解决小南后，带土拖着残缺的身体找到长门的遗体。看着长门脸上的微笑，带土嗤之以鼻，下一秒便把长门吸进了空间。眼下轮回眼已到手，带土将其移植到了左眼。稍作休息、修复身躯后，他找到了药师兜，决定根据鬼鲛用生命传来的情报，前去抓捕八尾和九尾。