内部阻力被铁腕肃清，金融革命稳步推进，西班牙王国的财力以惊人的速度增长。杨清很清楚，这笔巨大的财富必须转化为实实在在的武力，才能支撑起他统一欧洲的野心。他的下一个目标，是对西班牙军队进行一场脱胎换骨的军事改革。
此时的欧洲军队，主体仍是依赖贵族骑士和雇佣兵，组织松散，战术僵化，后勤混乱。杨清要打造的，是一支常备、职业、国家化的新式军团。
1 征兵与编制： 他废除了过时的封建征召制，推行基于人口比例的义务兵役制与志愿兵制相结合的方式，建立稳定的兵源。军队编制采用标准化的“团-营-连-排”体系，统一指挥，便于调度。军官选拔注重能力和战功，而非单纯看血统，为平民子弟提供了上升通道，培养忠于国家（实质是忠于杨清）的职业军官团。
2 装备标准化与量产： 他利用初步建立的工业基础（集中在武器制造、造船和纺织），全力推动武器装备的标准化和规模化生产。
3 训练与战术： 杨清亲自参与制定了严苛的训练大纲。强调队列纪律、火力齐射和刺刀冲锋（他改进了刺刀卡座，使其能可靠地装在枪口而不影响射击）。步兵方阵变得更加密集和灵活，炮兵与步兵的协同战术被重点演练。他还建立了专门的军官学校和士官培训体系，灌输新的战术思想和忠诚观念。
4 后勤与工程： 他建立了高效的总后勤部，统筹粮秣、弹药、被装的采购、储存和运输，确保大军远征无后顾之忧。同时，组建了专业的工兵部队，负责架桥、修路、筑城和爆破。
这场军事改革并非一帆风顺。旧式贵族将领对此嗤之以鼻，认为失去了骑士精神的军队毫无荣誉可言。但杨清用一次次的演习和一场小规模的、针对北非海盗据点的实战检验，证明了新式军团的威力。
在一次模拟对抗中，一个严格按照新式操典训练、装备燧发枪和刺刀的步兵营，在开阔地上轻松击溃了数量相当、由经验丰富的老兵组成的传统方阵。密集而迅速的火力投射，以及最后时刻雪亮的刺刀冲锋，彻底摧毁了对方的抵抗意志。
实战检验中，新组建的西班牙远征军以极小的代价，迅速攻占并摧毁了北非海岸一个经营多年的海盗巢穴，其高效的登陆、步炮协同攻坚和有序撤退，令欧洲各国的军事观察员瞠目结舌。
“西班牙军团……已经变得不一样了。”一位法兰西使者在其密信中写道，“他们的士兵像机器一样服从命令，火力猛烈得不可思议，行动如一人。这不再是我们所认识的西班牙军队了。”
军事改革的成功，极大地增强了杨清的信心和西班牙的军事实力。一支规模庞大、装备精良、训练有素、后勤保障有力的新式陆军和一支称霸大洋的远洋海军，成为了他手中最锋利的剑。
此时，欧洲的局势风云变幻。法兰西瓦卢瓦王朝与哈布斯堡家族的世仇未解，英格兰在伊丽莎白一世统治下羽翼渐丰，并与西班牙在海上和殖民地矛盾日益尖锐，德意志地区因宗教改革而分裂动荡，奥斯曼土耳其帝国在东地中海和巴尔干虎视眈眈。
杨清审视着这张欧洲棋盘，寻找着他霸业的第一块踏脚石。他的目光，首先投向了近在咫尺，且战略位置极其重要的——意大利半岛。那里是西班牙与法兰西争夺的焦点，也是哈布斯堡帝国看似稳固，实则暗流汹涌的软肋。
一场以全新战法和国家力量为后盾的征服，即将拉开序幕。