万历二十三年正月，闽南的海风带着湿冷的寒意，卷着咸腥气掠过泉州港。港口内，百余艘战船整齐列阵，船桅如林，改良红夷大炮的炮口直指海面，水师将士们身披铠甲，手持火铳，目光锐利如鹰隼——萧如薰已收到密报，盘踞台湾的海盗首领林风，正率三百艘战船、两万部众，勾结倭寇先锋，妄图突袭泉州，为丰臣秀吉的大军开路。
“传令下去！”萧如薰立于旗舰“镇海号”的甲板之上，声如洪钟，“命左翼水师分五十艘战船，绕至金门岛后，截断海盗退路；右翼水师率四十艘战船，佯攻海盗前锋，诱其深入；本帅亲率中军六十艘战船，在围头湾设伏，待海盗进入包围圈，即刻以火炮轰击！”
“遵令！”水师将领齐声应和，军令如流水般传至各船。
三日后，晨曦微露，海面上忽然飘来几缕黑烟。了望哨高声疾呼：“海盗战船！正向泉州方向驶来！”
萧如薰举目远眺，只见黑压压的战船群如蝗虫过境，为首的旗舰上，一面绣着“林”字的黑旗迎风招展。林风立于船头，身披镶金黑甲，手持大刀，高声叫嚣：“泉州守将听着！速速开城投降，饶尔等性命！若敢反抗，城破之日，鸡犬不留！”
右翼水师将领周弘谟依计行事，率四十艘战船迎了上去。两军刚一接触，周弘谟便下令“佯败”，水师战船故意散乱阵型，朝着围头湾方向退去。
林风见状，哈哈大笑：“大明水师不过如此！给我追！拿下泉州，金银财宝任尔等取之！”
海盗战船群立刻加速，如饿狼般扑向周弘谟的船队，一步步踏入了萧如薰布下的陷阱。
待海盗战船大半驶入围头湾，萧如薰猛地拔出腰间佩剑，直指苍穹：“开火！”
刹那间，中军六十艘战船的红夷大炮同时轰鸣，炮弹如雨点般砸向海盗战船。火光冲天，爆炸声震耳欲聋，海盗的前锋战船瞬间被轰碎，木屑与海水飞溅，惨叫声此起彼伏。
林风脸色骤变，方知中计，厉声吼道：“撤退！快撤！”
可迟了！左翼水师的战船如神兵天降，从金门岛后绕出，截断了海盗的退路。周弘谟的右翼水师也调转船头，杀了个回马枪。三面战船合围，火炮声、火铳声、喊杀声交织在一起，响彻整个围头湾。
萧如薰坐镇中军，冷静指挥：“命火铳手用三段击战术，压制甲板上的海盗！跳帮队准备，待敌船靠近，即刻登船厮杀！”
大明水师的火铳手轮番射击，海盗们被压制在船舱内，抬不起头。跳帮队的将士们手持长刀，借着战船相撞的瞬间，纵身跃上海盗战船，与海盗展开近身肉搏。
林风见大势已去，带着数十艘战船拼死突围，却被萧如薰的旗舰拦住。萧如薰立于船头，怒目而视：“林风！你盘踞台海，劫掠百姓，勾结倭寇，罪无可赦！今日便是你的死期！”
林风咬牙切齿，挥刀冲向萧如薰：“萧如薰！老子跟你拼了！”
两船相接，萧如薰手持镇倭剑，纵身跃上海盗旗舰。剑光闪烁，与林风的大刀碰撞，火星四溅。几个回合下来，林风渐感不支，被萧如薰一剑挑飞大刀，反手擒住。
“绑了！”萧如薰一声令下，亲兵立刻上前，将林风捆了个结实。
群龙无首的海盗们纷纷弃械投降，这场台海鏖战，以大明水师大获全胜告终——击沉海盗战船百余艘，俘虏万余人，缴获火炮两百余门，彻底粉碎了海盗与倭寇的联合突袭计划。
战后，泉州城内欢声雷动，百姓们提着酒肉，涌向港口，犒劳水师将士。萧如薰却无暇庆贺，他深知，海盗余党仍盘踞在台湾岛，若不彻底肃清，沿海永无宁日。
他当即下令，将林风等海盗首领押往京城问罪，对被俘的海盗士兵，则采取“招抚为主，严惩为辅”的策略——凡愿意归降者，发放粮食和农具，编入沿海军屯，开垦荒地；凡顽固不化者，发配至西北充军。
消息传到台湾，海盗余党人心惶惶。萧如薰趁热打铁，派使者前往台湾，晓谕利害：“大明既往不咎，若尔等放下武器，归顺朝廷，可免一死，还能分得土地，安居乐业。若执意顽抗，大军一到，玉石俱焚！”
海盗余党中，有不少人本是沿海渔民，因生计所迫才落草为寇。听闻朝廷的招抚政策，纷纷倒戈投降。仅半月时间，台湾岛的海盗余党便尽数归降。
萧如薰随即奏请万历皇帝，在台湾设立“澎湖巡检司”，派驻水师两千人，镇守台海；又从福建、广东迁徙百姓万人，前往台湾开垦荒地，推广军屯之法。自此，台海一带海晏河清，百姓安居乐业。
二月底，萧如薰正在泉州水师营地训练将士，亲兵忽然来报：“尚书大人！京城急报，丰臣秀吉病逝，日本内乱，原定三月突袭大明的倭寇大军，已尽数撤回国内！”
萧如薰闻言，长舒一口气。多日来的紧绷神经，终于松弛下来。他望着波涛汹涌的海面，心中感慨万千——从朝鲜抗倭，到蓟辽、宣府推屯，再到台海驱寇，一路走来，虽历经艰险，却终究守住了大明的疆土，护佑了百姓的安宁。
徐光启闻讯赶来，满面喜色：“萧尚书！天佑大明！丰臣秀吉一死，倭寇内乱，沿海之患彻底解除了！这下，咱们可以安心整顿海防，推广军屯了！”
萧如薰笑着点头，目光却望向远方的京城：“沿海虽安，但朝堂之上，党争未息；西北蒙古，仍有异动。大明的安稳，还需我辈继续守护啊。”
他顿了顿，又道：“徐先生，烦请你草拟一份奏折，奏请陛下，在沿海各港口设立水师学堂，培养精通海战和火器的将领；同时，扩大台海军屯规模，让台湾成为大明的海防屏障。”
徐光启拱手应道：“尚书所言极是，我这就去草拟奏折！”
夕阳西下，金色的余晖洒在海面上，波光粼粼。萧如薰立于甲板，手扶船舷，望着归航的渔船和岸边炊烟袅袅的村落，嘴角扬起一抹欣慰的笑容。
他知道，这太平盛世，来之不易。而他守护大明的使命，远未结束。