在灵霄界暂时稳定之后，苏玄、林婉儿和凤舞并未急着返回灵墟，而是与灵霄帝君一同展开对“混沌暗影”的深入调查。他们穿梭于灵霄界各大古老的仙宫秘阁，翻阅着堆积如山、尘封已久的古籍，试图从中找到彻底封印“混沌暗影”的方法以及与之相关的更多隐秘线索。
一日，苏玄在一座古老仙阁的最深处，发现了一本散发着微弱光芒的古籍。古籍的封皮上刻满了神秘的符文，苏玄运转混沌灵根，才勉强解读出上面的字迹——《灵霄古纪·暗影溯源》。苏玄心中一喜，赶忙翻开古籍，仔细研读起来。
随着阅读的深入，苏玄的脸色愈发凝重。古籍中记载，“混沌暗影”并非自然产生的力量，而是上古时期一位堕入魔道的绝世仙尊——暗影仙尊所创造。暗影仙尊妄图以“混沌暗影”之力统治三界，为此引发了一场惨烈的上古大战。最终，数位顶尖仙尊不惜牺牲自身，才将暗影仙尊封印在灵霄界的一处神秘之地，“混沌暗影”也随之被封禁。但暗影仙尊在被封印前留下了后手，若三界出现动荡，灵气失衡，封印便有可能松动，“混沌暗影”也会趁机复苏。
苏玄将这一发现告知了灵霄帝君、林婉儿和凤舞。众人听闻后，意识到问题的严重性。灵霄帝君皱着眉头说道：“如此说来，灵墟中的仙魔争霸导致灵气混乱，很可能就是‘混沌暗影’复苏的诱因。”
林婉儿点头道：“看来我们在灵墟所经历的一切，并非偶然，背后或许都有暗影仙尊的残余势力在推动。”
凤舞则若有所思地说：“若想彻底解决‘混沌暗影’的威胁，我们不仅要修复灵霄界的封印，还需在灵墟中找到并铲除暗影仙尊的残余势力，从根源上解决问题。”
就在众人商讨对策之时，灵霄界的情报人员传来消息，在灵霄界与灵墟的交界处，出现了一些异常的灵力波动。这些波动与“混沌暗影”的气息极为相似，疑似有暗影仙尊的残余势力在暗中活动。
灵霄帝君立刻决定派遣一支精锐的仙人大军，由他亲自率领，前往交界处探查。苏玄、林婉儿和凤舞也一同加入了队伍。众人化作一道道流光，朝着灵霄界与灵墟的交界处疾驰而去。
当他们赶到时，发现此处弥漫着一层淡淡的黑色雾气，雾气中不时闪烁着诡异的光芒。苏玄运转混沌灵根，感知到雾气中隐藏着一股强大而邪恶的力量，正悄然蛰伏着。
灵霄帝君一声令下，仙人们迅速结成战斗阵型，小心翼翼地朝着雾气深处推进。突然，一群黑影从雾气中窜出，这些黑影形似人类，但周身散发着浓郁的黑暗气息，眼神中充满了疯狂与杀意。黑影们手持黑色利刃，朝着仙人们疯狂扑来。
苏玄抽出幽蓝幻星剑，施展出“混沌九阳千重斩”，金色剑气纵横交错，瞬间便将冲在最前面的黑影斩杀。林婉儿施展出“仙灵蝶舞剑”，粉色剑光如花瓣般飘落，每一道剑光都准确地击中黑影，黑影们被击中后发出阵阵惨叫，身体逐渐消散。凤舞则施展出“凤凰炎爆术”，无数团五彩火焰朝着黑影射去，火焰爆炸产生的冲击力将黑影们炸得四分五裂。
灵霄帝君施展出“灵霄神雷咒”，天空中顿时乌云密布，一道道粗大的金色神雷轰然落下，神雷所到之处，黑影们纷纷化为灰烬。然而，黑影的数量众多，源源不断地从雾气中涌出，仙人们陷入了苦战。
苏玄在战斗中发现，这些黑影虽然实力不强，但它们似乎受到某种神秘力量的操控，前赴后继，毫无惧意。他运转混沌灵根，试图感知这股操控力量的源头。经过一番探寻，苏玄发现，在雾气的深处，有一座黑色的祭坛，祭坛上散发着强烈的黑暗气息，正是这股气息在操控着黑影。
苏玄将这一发现告知灵霄帝君，帝君当机立断，决定带领一队高手，突破黑影的包围，直捣祭坛。苏玄、林婉儿和凤舞紧跟在帝君身后，他们施展出各自的绝技，一路披荆斩棘，朝着祭坛冲去。
当他们靠近祭坛时，一名黑袍人出现在祭坛之上。黑袍人身材高大，面容隐藏在阴影之中，他看着苏玄等人，发出一阵阴森的笑声：“你们终究还是来了，不过，这一切都在我们的计划之中。”
灵霄帝君怒喝道：“你是何人？为何在此兴风作浪？”
黑袍人冷笑一声：“我乃暗影仙尊座下护法，奉尊主之命，唤醒‘混沌暗影’，重塑三界秩序。你们今日都将葬身于此！”说罢，黑袍人双手结印，口中念念有词。祭坛上的黑暗气息瞬间暴涨，化作一道道黑色的触手，朝着苏玄等人缠来。
苏玄等人能否战胜黑袍人，摧毁祭坛？暗影仙尊的残余势力又有着怎样更为阴险的计划？一切都充满了悬念，等待着他们去揭晓。