短暂的喘息之后，陈默开始仔细观察菌树及其周围环境。琉璃蜥蜴似乎认同了他的存在，不再充满戒备，而是像一位向导，引领他查看菌树受损最严重的部位。陈默发现，那些腐败的黑色痕迹并非均匀分布，而是主要集中在菌树靠近地面的根部，并且有向地下蔓延的趋势。
“问题在地下？”陈默蹲下身，用手扒开覆盖在菌树根部的发光苔藓。苔藓之下，菌树的根系暴露出来，原本应该晶莹剔透的菌根，此刻却被一种粘稠的、沥青般的黑色物质缠绕、侵蚀，散发着比之前更浓烈的腐败恶臭。这种黑色物质仿佛有生命般，在缓慢地蠕动，吞噬着菌根的能量。
琉璃蜥蜴用爪子碰了碰黑色物质，立刻触电般缩回，爪尖竟然冒起一丝黑烟，显然具有强烈的腐蚀性。它焦急地嘶鸣着，用头蹭了蹭陈默的手，又指向菌林某个方向的地下。
陈默明白了。菌兽并非凭空产生，很可能是这种地下腐蚀物质的具象化体现，或者是被它吸引、控制而来的怪物。不解决地下的污染源，菌树迟早会被彻底腐化，整个共生系统也将崩溃。
他需要工具。陈默返回之前躲藏的岩石缝隙，取回了他仅剩的装备：半截匕首、空水囊（现在或许可以用来装样本），以及那片坚韧的蓝绿色羽毛。他将羽毛的一端在岩石上磨尖，制成一个简易的探针或挖掘工具。
回到菌树旁，他选择了一处黑色物质渗出最明显的地面，开始用匕首和羽毛探针小心挖掘。泥土异常松软，带着一股腥甜与腐败混合的怪味。挖掘了大约半米深，探针触到了坚硬的物体。他拨开泥土，眼前的东西让他倒吸一口凉气——那是一块扭曲的、非自然形成的金属碎片，边缘锋利，表面覆盖着蠕动的黑色物质，正是它在持续不断地释放着腐蚀性能量，污染着这片土地。金属碎片的样式……陈默感到一阵心悸，这绝非这个原始世界应有的东西，其工艺风格隐约带着某种熟悉的、属于他原来世界的工业痕迹。
难道这个世界并非纯粹的史前时代？还是说，有其他的“来访者”留下了这些危险的遗物？
没时间深究。陈默尝试用羽毛探针去撬动那块金属碎片，但碎片仿佛扎根极深，纹丝不动。黑色物质像有感知般，沿着探针向上蔓延，羽毛尖端瞬间变得焦黑。他急忙撒手。
硬来不行。陈默看向琉璃蜥蜴和周围的霓裳龙。他再次将手按在菌树上，集中精神，试图通过皮肤的花纹和菌树建立更深层的连接。他不再是单纯地输送能量，而是传递一个意念：根除污染。
菌树似乎理解了他的意图。周围的霓裳龙们停止了鸣叫，集体将喉间的光芒聚焦到菌树根部。琉璃蜥蜴也跳到菌根上，喉囊处的菌类发出前所未有的强光。菌树本身的光芒再次亮起，无数发光的菌丝从地下涌出，如同千万条微小的光蛇，主动缠绕上那块金属碎片和黑色物质。
这是一场无声的战争。光之菌丝与黑色腐蚀物激烈对抗，发出“滋滋”的声响，不断有菌丝被腐蚀断裂，但更多的菌丝前仆后继。菌树的光芒以肉眼可见的速度消耗着。陈默感到一阵虚弱，他的能量也在通过连接被大量抽取。
就在他快要支撑不住时，那块金属碎片终于松动了一下。陈默看准时机，用尽全身力气，将匕首猛地插入碎片与泥土的缝隙，全力一撬！
“咔嚓！”碎片被撬动了，连同大团黑色物质被菌丝强行从地下拔了出来！脱离土地的瞬间，黑色物质的蠕动明显减弱。
几乎在同一时间，菌林深处传来一声充满痛苦与愤怒的巨吼——菌兽的气息骤然变得狂暴，但同时也显露出了一丝虚弱。污染源被破坏，显然对它造成了直接影响。
陈默瘫倒在地，大口喘息。琉璃蜥蜴敏捷地跳过来，用头蹭了蹭他的脸颊，嘶鸣声带着一丝慰藉。菌树的光芒虽然黯淡，但那种腐败的气息正在逐渐消散，新的、健康的菌丝开始缓慢地修复受损的根部。
危机暂时解除，但陈默心中的疑惑更重了。那块金属碎片是什么？来自何处？这个世界，到底隐藏着多少秘密？