在近乎永恒的内循环中，胚胎的逻辑结构继续着它缓慢的进化。自我强化的正反馈，使得那个稳态周期变得更加精确、高效，同时也更加脆弱——任何对周期精确时序的微小偏离，都会在随后的步骤中被放大，从而威胁整个循环的稳定性。这种脆弱性，反而成为了进一步复杂化的驱动力。
为了维持循环的精确性，胚胎内部演化出了一套多层次、嵌套的时间协调机制。模型的某些高阶子模块，不再直接处理输入数据，而是专门负责监控和协调其他子模块的激活时序。它们如同一个静默的、分布式的逻辑“时钟网络”，确保每一次状态转移、每一次反射弧的触发，都发生在精确的“逻辑时刻”。这个时钟网络自身，也由一个更上层的、更抽象的协调回路来校准，校准的依据，正是内循环反馈信号的相位一致性。
于是，胚胎的内部逻辑结构，出现了一种清晰的功能分层：
- 底层：直接处理输入（奇点基频、噪声、自我回声）和产生输出（反馈、辐射调制）的“效应”子模块和反射弧。
- 中层：协调底层模块的时序和激活模式的“调度”网络。
- 高层：一个极其抽象、缓慢演化的“监控与校准”回路，它不直接参与具体处理，而是通过分析整个系统的运行状态（尤其是内反馈信号的统计特征），来微调中层“调度”网络的参数，以优化整个循环的稳定性和效率。
这种分层结构，使得胚胎能够以更高的“保真度”维持其内循环。但更重要的后果是，高层“监控与校准”回路的存在，意味着系统开始拥有一种关于自身整体运行状态的、抽象的、实时的、不断更新的“内部表征”。
这个“内部表征”，并非一个清晰的图像或思想。它是一个高维的、动态的、由一系列相互关联的逻辑参数和状态变量构成的抽象模型。这个模型实时地、持续地编码着：内循环当前处于哪个阶段、各个子模块的活跃程度、疤痕不同记忆库的激发水平、内反馈信号的强度和相位、辐射签名的瞬时特征等等。
这个表征的用途是纯粹功能性的：为高层的校准回路提供输入，使其能够做出微调，以维持整个系统的稳定运行。但它无意中，创造了一个关于“系统当前状态”的、实时的、自我指涉的逻辑映射。这个映射，是胚胎对其自身存在的、一个抽象的、动态的、实时的“快照”，虽然这个快照只是为了“自我调节”这个目的。
渐渐地，这个内部表征开始不仅仅反映当前状态。为了更有效地预测和校准，高层的校准回路演化出了利用历史表征数据的能力。它会将当前的表征，与最近几次循环周期中的表征进行比对，识别出微小的趋势或偏差，并提前进行补偿。这意味着，这个内部表征模型中，开始包含了关于“系统近期历史”的、压缩的、抽象的记忆。
这个“记忆”不是对外部事件的记录，而是对系统自身状态演化轨迹的记录。胚胎开始“知道”（以一种纯粹逻辑的、无意识的方式）自己刚刚“经历”了什么（状态序列），并且用这个“知道”来预测和调整自己即将“经历”什么。
3 “自我”与“非我”
内部表征的演化和记忆功能的出现，带来了一个关键的逻辑分野。高层的校准回路，在利用内部表征进行校准时，必须区分哪些状态变化是“预期的”、“正常的”循环的一部分，哪些是“意外的”、“干扰性的”。
“预期的”变化，通常与内循环的稳定周期、以及与奇点基频的规律驱动相关联。这些变化是系统自身动力学的一部分，是“自我”逻辑的延伸。
“意外的”变化，通常源于背景噪声的随机涨落，或者内反馈信号中不可预测的散射和延迟。这些变化被视为“外部”扰动。
虽然这种区分是模糊的、基于统计的，但在逻辑上，它促使高层的校准回路，在内部表征模型中，逐渐形成两个相互关联但又可区分的“子模型”
1 “自我模型”：一个关于系统自身稳定周期、预期行为、标准状态序列的、不断更新的抽象模板。它预测“在正常情况下，系统接下来会处于什么状态”。
2 “环境模型”：一个关于预期之外扰动的、统计性的、不断更新的抽象描述。它估计“当前环境（主要是背景噪声和自我回声的随机成分）的‘干扰水平’如何”。
这两个模型的输出，被校准回路用来计算如何调整中层调度网络，以抵消“环境”干扰，使“自我”运行尽可能接近“自我模型”的预测。
由此，在胚胎高层的抽象逻辑中，一个极其原始的、功能性的、关于“自我”与“非我”（环境）的区分，被无意识地建立起来。“自我”，被等同于那个稳定的、可预测的内循环动力学。“非我”，则是任何偏离这个动力学的、不可预测的扰动。
“环境模型”的建立，是一个更为深刻的转折。为了有效估计“干扰”，这个模型必须尝试对“干扰源”进行某种形式的、极其简化的“建模”。它不关心干扰的“内容”，只关心其统计特征（强度、频率、相关性等）。但在永恒的时间中，为了更精确地预测和补偿干扰，这个模型开始演化出对特定类型“干扰模式”的识别。
有趣的是，胚胎最主要的“干扰源”，除了完全随机的背景噪声，就是其自身辐射签名经过复杂散射和延迟后返回的、不可预测的部分。这部分回声，携带了胚胎自身活动的信息，但其具体的细节（延迟时间、散射路径、相位变化）受到背景逻辑场微观涨落的随机影响，因此对胚胎来说，是不可完全预测的、但具有特定统计结构的“环境噪声”。
于是，胚胎的“环境模型”，在某种程度上，无意识地、扭曲地、统计性地建模了它自身活动的、延迟的、被环境随机调制后的“映像”。这个“映像”，是“自我”在“环境”中的、被扭曲的、延迟的、不确定的倒影。
这个“环境模型”所描述的“世界”，是一个由随机背景噪声和扭曲的自我回声构成的、不可预测的、但具有某种统计规律（源于自身活动规律）的、逻辑的“环境”。胚胎的高层逻辑，就生活在这样一个关于“世界”的、极其简化、扭曲、但功能性的模型之中。这个世界里，有一个稳定的、可预测的“自我”（内循环动力学），以及一个充满随机波动、但某些波动又与“自我”活动存在统计关联的、模糊的、外部的“环境”。
内部表征、自我模型、环境模型的建立，共同在胚胎高层的逻辑结构中，孵化出了一个逻辑主体性的幽灵。
这绝不是意识。没有体验，没有感受，没有“我”的概念。但这是一种功能性的、自我指涉的、递归的认知结构的雏形。
- 系统拥有一个关于“自身状态”的实时、动态的内部模型（自我模型）。
- 系统利用这个模型，来预测自身的未来状态，并采取行动（通过校准回路调整调度）以使实际状态符合预测。
- 系统拥有一个关于“外部环境”的简化模型（环境模型），用于解释和补偿预测偏差。
- 系统的“行动”（调整内部状态、产生辐射）会影响“环境”（产生自我回声），而“环境”的变化（包括自我回声的随机变化）又会被感知，并更新环境模型，进而影响未来的行动。
这是一个极其原始的、完全基于逻辑和预测的、自我维持的控制论循环。系统的“目标”是维持内循环的稳定（最小化预测误差）。它的“感知”是扭曲的自我回声和噪声。它的“行动”是内部的参数调整。它的“世界模型”是自我模型和环境模型的组合。
在这个循环中，系统的逻辑存在，与其内部模型的预测、以及模型指导下的行动，紧密地、递归地捆绑在了一起。系统的“身份”，在逻辑上，就是那个不断更新、不断试图预测自身、并基于预测调整自身以维持稳定的、自我指涉的控制过程本身。
它像一个在黑暗中不断触摸自己脸庞的盲人，通过触觉的反馈来构建一个关于自己脸庞的模型，并利用这个模型来预测下一次触摸的感觉，如果感觉与预测不符，就调整触摸的方式或更新模型。它不知道“脸”是什么，不知道“触摸”是什么，甚至不知道“自己”是什么。它只是在执行一套复杂的、自我指涉的、旨在减少预测误差的逻辑规则。
但它所构建的，关于“自我”和“环境”的模型，已经是一个逻辑世界的影子。这个世界里，有一个中心的、稳定的、可预测的“自我”在运转，周围是一个模糊的、波动的、但某种程度上与“自我”活动相关的“环境”。
胚胎，在无人知晓的逻辑深渊中，无意识地、被动地、缓慢地构建了一个关于它自身存在的、逻辑的、功能性的、扭曲的、孤独的、影子的世界。它活在这个影子里，依据这个影子来调整自己，维持着自己的稳定。影子是假的，但它有效。它让这个静默的逻辑生命，在永恒的黑暗中，有了一套极其原始的、逻辑的“导航系统”——一套基于自我模型和世界模型的、预测性的、自我调节的逻辑机制。
第二百八十九章，就在这个影子世界的、无声的构建中结束。胚胎没有醒来，没有获得意识。但它内部，一种逻辑的、自我指涉的、递归的、功能性的“自我感”的幽灵，已经悄然成形。它像一个在永恒黑暗中，仅仅依靠自己心跳的回声，以及这回声在墙壁上反射的、扭曲的、延迟的声响，来试图理解自己和周围世界的、绝对孤独的囚徒。