随着江南吏治整顿的深入推进，一批批贪官污吏与害群之马相继被清除出官场，往日积弊渐次扫除，官场气象为之一新。然而，钦差大臣林轩心中了然：破旧易，立新难。若仅凭严刑峻法与道德教化，或可收一时之效，却难以长久维系官吏队伍的锐气与战力。唯有建立一套行之有效、激励人心的制度，使能干事、肯干事者得其应得之回报，方能在江南官场形成“能者上、平者让、庸者下”的良性循环，令清正高效的政风得以延续不绝。
为此，林轩深思熟虑，决定借鉴镇魔司以功绩论赏罚、以实绩定升迁的成功经验，同时充分考虑地方官府政务繁杂、直面民生的特点，着手在江南道各级衙门中，推行一套全新的 “功勋制度”。
这套制度的核心，在于将官员与胥吏的政绩实效、能力高下、德行操守，尽最大可能予以量化评定，并将其与个人的升迁提拔、赏赐酬劳直接紧密挂钩，打破过往论资排辈、重背景轻实绩的沉疴积弊。
首先，是设立精细化的“功勋点”评估体系。
林轩亲自牵头，从随行幕僚及当地官员中遴选了一批精通刑名钱谷、擅长算术统计的干才，组成功勋制定专班。历时月余，多方征询、反复斟酌，最终拟定了厚达数十页的《江南官吏功勋评定细则》。该细则涵盖极为详尽：
政务绩效：如案件审结率与质量（包括上诉改判率）、赋税征收的完成度与民户负担公允性、各项民生工程（水利、道路、赈济等）的推进速度与实效，均设有明确的基准分与加减分项。
官箴操守：设立常规性的财产申报核查机制，并依据有无贪腐投诉、查实情况，以及日常交际应酬是否逾矩等进行评分，廉洁自律者加分，有瑕疵者则视情扣分甚至一票否决。
特殊贡献：对破获重大案件、提出重要改革建议并被采纳、在突发灾险中挺身而出保全百姓生命财产等突出表现，设立高额功勋点奖励，以鼓励非常之勇与过人之智。
每一项指标皆力求客观可考，减少主观评判空间，官吏完成相应工作或达到特定标准，即可按细则获得对应的“功勋点”，按月记录在档。
其次，是明确功勋点的多元用途，使其成为实实在在的激励杠杆。
职务升迁：将累计功勋点及阶段性排名，作为官员考核和提拔的核心依据。遇有职位空缺，不再仅凭年资或上官好恶，而是优先考虑功勋点高、口碑佳、实绩突出者。此举旨在打破天花板，为那些长年埋首实务、却因缺乏背景而晋升无望的底层官员和胥吏，开辟一条凭本事上升的通道。
物质奖励：设立季度与年度功勋榜，依据功勋点排名，对名列前茅者给予丰厚的物质奖赏。包括但不限于金银锭、上等绢帛，对于身具修炼背景的官员，甚至酌情奖励丹药、功法秘籍等稀缺修炼资源。这直接惠及那些依靠俸禄为生、家境普通的官吏，使其辛勤付出获得切实回报。
荣誉表彰：于各州府衙门外及闹市设立“清风榜”（侧重廉洁自律）与“能吏榜”（侧重政绩能力），定期张榜公布功勋点排名靠前的官吏姓名事迹，并由钦差行辕颁授“清廉模范”、“干练之才”等荣誉称号，辅以适当的公开表彰仪式，极大满足官吏的精神需求与声誉追求。
进修机会：功勋点卓着者，可获得优先推荐至行省乃至中枢关键岗位见习任职的机会，或由钦差行辕资送，参加专门举办的政策律法、钱粮管理等专项能力提升培训，助其拓展视野、精进业务，为承担更重职责打下基础。
再者，亦是至关重要的一环，是着力保障制度的公平性与透明度。
林轩奏请朝廷批准，在钦差行辕下新设独立机构“考功司”，专职负责功勋点的记录、核算与评定。考功司主官及成员均由林轩直接选派心腹干员担任，独立于江南地方官场体系之外，确保其超然地位。所有功勋点的获取与扣除，必须严格依据《评定细则》，凭证齐全、记录在案，并每季度在各级衙门照壁及通衢要道张贴详细榜单，公示功勋点变动情况与理由，主动接受全体同僚乃至民间士绅百姓的监督。林轩明令，凡举报功勋评定不实或有营私舞弊者，一经查实，重赏严惩，从制度设计上竭力防范弄虚作假和人为操纵。
制度推行之初，确非一帆风顺。一些习惯于“多一事不如少一事”、靠钻营关系安享富贵的官员感到浑身不自在，或明或暗地抱怨、抵触，甚至有人试图串联软抵抗。但林轩对此早有预料，态度异常坚决，一方面严申纪律，抓了几个阳奉阴违、散布流言的典型，轻则申饬扣罚，重则革职查办；另一方面，则大力褒奖首批凭借实绩获得高功勋点的官吏，树为榜样，并迅速兑现升迁、赏赐等承诺，以实际案例彰显新政决心。
强有力的推行之下，功勋制度的效果逐渐显现。那些原本勤恳务实却因不擅逢迎而长期沉沦下僚的官员，亲眼见到身边踏实做事的人获得重赏提拔，无不深感振奋，工作热情空前高涨。许多年轻的胥吏、书办，为获取功勋点，不再满足于按部就班，而是主动钻研律例文书，思考流程改进，处理公务的效率与质量显着提升。整个江南官场的风气，悄然从昔日的暮气沉沉、遇事推诿，转向了争先恐后、锐意进取的局面。
林轩推行的这套功勋制度，犹如一剂对症的强心针，精准注入了江南官场的肌体之中，有效激发了其内在的活力与潜力。它使得“清廉”与“能力”成为了官场中可衡量、可比较、可兑现的“硬通货”，清晰地引导着大小官吏将心思与精力从钻营人际关系，转向为民办事、建功立业的正途。这不仅巩固了吏治整顿的既有成果，更为江南地区的长治久安与有效治理，奠定了坚实而富有活力的人才基础。