人事任免与初步清洗，如同一次精准的外科手术，刮去了镇魔司肌体表面最显眼的腐肉。但林轩深知，这仅仅是开始。一个积弊已久的庞大机构，其病灶早已深入骨髓，渗透在制度的缝隙、风气的流转乃至每一个日常细节之中。要想真正打造一个高效、忠诚、纯粹的镇魔司，必须进行一次彻彻底底的刮骨疗毒。离京之日迫在眉睫，时间紧迫，林轩决心趁热打铁，以雷霆万钧之势，在最短时间内将镇魔司锻造成一块无隙可乘的铁板。
接下来的数月，从帝都总部到各州郡分司，一场自上而下、由内而外的整顿风暴席卷而至，其力度之强、范围之广、谋划之细，皆为镇魔司成立以来所未有。
第一，思想整风，信念重塑之本。
林轩亲力亲为，闭门数日，字斟句酌，撰写出《镇魔司守则》。守则开篇如洪钟大吕，明确宣告：“镇魔之责，在于护国佑民，斩邪除恶，非争权夺利之阶！” 这短短一句话，被裱糊起来悬挂于总部大堂及各分司议事厅最显眼处。林轩下令，司内上下，从指挥使到最底层的杂役，必须人人熟读背诵，不仅要知其然，更要知其所以然。他建立了定期的考核机制，由新成立的学风督查组负责抽查，背诵不熟、理解不透者，轻则训诫扣饷，重则停职反省。
不仅如此，林轩更是亲自披挂上阵，连续召集各级官员进行大规模训话。他没有坐在高堂之上，而是走入校场、值房，与中低级官员乃至普通卫士面对面。他的声音并不总是激昂，有时低沉而充满力量，深刻剖析以往存在的种种歪风邪气——结党营私、敷衍塞责、欺上瞒下、畏难避险。同时，他大力挖掘并表彰那些在以往被忽视、却始终忠于职守、在除魔一线立下功勋的底层人员。一次隆重的授勋仪式上，数名伤痕累累的低阶斩妖使被破格提拔，赏赐丰厚，事迹广为传颂。榜样之力，如暗夜明灯，迅速点燃了那些心怀正气者的希望与干劲，引导着机构风气的悄然转变。
第二，业务能力大考核，汰弱留强。
林轩认为，空有忠诚而无能力，便是对职责的亵渎。他责令各司主官，根据战斗、文书、侦查、后勤等不同岗位特性，制定了极其详尽的考核标准。战斗人员需考核个人武力、阵法配合、妖魔特性辨识；文职人员需考核案牍处理速度与准确性、情报分析研判能力；侦查人员则考验其潜伏、伪装、追踪、反追踪等技巧。考核绝非走过场，由总部派出的专员交叉监考，标准严格统一。
首次考核结果公布，不合格者竟达三成。林轩并未简单地将他们清退，而是设立了“强化训导营”，由经验丰富的老手担任教习，进行为期一月至三月不等的魔鬼训练。训练期间待遇减半，期满后进行复核。一次复核不过，尚有第二次机会；若两次仍不通过，则说明其确实难以胜任镇魔司之职，一律调离关键岗位，或转为辅役，或予以清退。此举在内部引起巨大震动，无人再敢心存侥幸，刻苦修炼、钻研业务蔚然成风，整个机构的专业素养和执行效率得以飞速提升。
第三，财务与资源审计，堵塞漏洞。
机构的腐败，往往始于资源。林轩任命以铁面无私着称的新任监察处处长，联合精于算计的账房大先生，组成联合审计组，对镇魔司近五年来的所有账目、物资调配、资源入库与领用，进行了一次地毯式彻查。审计组权限极高，可调阅任何档案，质询任何人员。
过程果然阻力重重，旧账模糊、凭证缺失、巧立名目等问题层出不穷。但审计组顶住压力，顺藤摸瓜，最终查出了多处触目惊心的漏洞。追回被贪污的银钱数以万计，被挪用的修炼丹药、灵材宝器更是不计其数。数名涉及其中的中高层官员，包括两位此前清洗中侥幸脱身的分司副指挥，证据确凿，被当即拿下，严惩不贷，家产充公。此举如同在肥硕的蛀虫群中投入滚烫的烙铁，震慑效果无以复加，此后账目清晰、资源调配效率大增。
第四，情报系统肃清与整合，重中之重。
情报乃镇魔司之耳目，若耳目不清，则全身皆盲。此项绝密任务，林轩全权交由心腹莫北川主持。莫北川行动极为隐秘，动用了一支直接对他负责的暗影小队，对镇魔司遍布全国的情报网络进行了一次无声却彻底的大清洗。
所有身份存疑、近期行为异常、尤其是与国师府、七皇子府等外部势力有过密接触记录的暗桩、线人，都被列入名单。处理方式因人而异：情节较轻者，被以各种理由调离情报中枢，安置到无关紧要的闲职；确有通敌嫌疑者，则在某个深夜或偏僻角落“意外失踪”；对于一些难以立刻判断的灰色人物，则建立隔离观察档案，暂时冻结其情报权限。与此同时，莫北川从军中、民间秘密吸纳了一批家世清白、能力出众且背景干净的新血，逐步替换掉被清理的节点，并重新设计了更加严密、多为单向联系的情报传递链条，极大降低了核心情报泄露的风险。
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第五，清除异己，精准打击不留后患。
风暴过后，水面下仍有暗流。对于那些在初步清洗中因隐藏较深或态度暧昧而侥幸漏网，以及仍在观望、首鼠两端的官员，林轩采取了更精准、也更无情的打击策略。
他娴熟地运用权术：对某些资历较老、影响较大的墙头草，予以“明升暗降”，调任诸如“典籍库总管”、“皇家陵园护卫统领”之类的虚职，剥夺其实权；对某些桀骜不驯、仍有潜在威胁者，则“委以重任”，派遣其执行一些极其危险、九死一生的任务，借妖魔或敌对势力之手除之；对于确有把柄可抓的，则指令监察处暗中搜集其贪腐、渎职的确凿证据，选择恰当时机，一举拿下，公告司内，名正言顺。
整个过程，林轩展现了与其年龄不符的高超政治手腕和铁血风格。他不出手则已，一出手必中要害，绝不给对手喘息反扑之机。镇魔司内部一时间风声鹤唳，人人自危，却也使得那些尸位素餐、心术不正者被彻底清除。
当这场轰轰烈烈的全面整顿接近尾声时，效果立竿见影。镇魔司这台曾经略显臃肿、内部倾轧不断的庞大机器，仿佛被重新锻造、打磨、上紧了每一颗螺丝，变得结构紧凑、纪律严明、反应迅捷。令行禁止，指哪打哪，已成为一种本能。那些真正有志于斩妖除魔、护卫黎民的官员，感受到了前所未有的舒畅和蓬勃干劲，他们明白，那个他们曾经向往的、纯粹而强大的镇魔司，真正回来了。
林轩这番雷厉风行、甚至不乏狠辣的手段，也再次让朝野各方势力见识到了他的果决与难以撼动的意志。虽然此举必然得罪了许多旧有利益的关联者，但也彻底树立了他在镇魔司内说一不二、无人敢挑战的绝对权威。一部高效的战争机器，已准备就绪，只待它的掌控者发出指令。