铁山“肉身筑基”所带来的震撼与激励尚未完全平息，青云宗内又迎来了一项标志性的事件——科学预备班第一阶段的基础课程，正式迎来了结业考核。
格物堂内，气氛肃穆。二十名学员伏案疾书，或凝神计算，或皱眉思索。考核内容函盖了《算术》、《灵力力学》、《丹道化学原理》三门内核课程的基础理论与结合修仙实际的应用题。这不仅是对知识的检验，更是对数月来所接受的、全新思维方式的一次全面审视。
考核结果，如同林枫所预期，呈现出清淅的梯队分布
优秀者约占三成，以林妙妙为首。她对数理、几何有着近乎本能的亲和力，试卷上逻辑严密，推演精准，尤其在结合阵法的力学应用题上，展现出了独到的见解。孙小梅紧随其后，她在化学原理上的天赋再次得到印证，对药性粒子反应的分析鞭辟入里。还有两名原本在传统修炼中表现不算突出的弟子，却在科学思维的框架下找到了感觉，成绩斐然。
良好者约占四成，如周大壮、水韵等。他们或许在某一门课上略有短板，但态度认真，基础扎实，能够较好地理解和应用所学知识，解决大部分常规问题。周大壮在涉及丹房管理和药材计算的题目上表现尤佳。
及格者约占三成，以赵岩、石猛为代表。他们大多性格直率，偏向实战，对需要静心推演的理论感到些许吃力。虽然成绩勉强过关，但相比以往纯粹的“修炼莽夫”，已然能够理解一些基础的力学概念和丹药原理，看待问题的角度潜移默化中发生了改变。赵岩那道关于“如何利用杠杆原理优化重兵器挥砍效率”的论述题，虽文笔粗糙，却思路正确，得到了林枫的圈点认可。
考核结果张榜公布，并与贡献点奖励挂钩，进一步激励了学员们对科学知识的重视。
面对这参差不齐但皆有进步的结果，林枫并未采取一刀切的教程方式。他在格物堂宣布了 “因材施教，分级深化”
“自即日起，考核优秀者，可申请进入‘专题研究组’。林妙妙，你可牵头‘拓扑阵法与灵力流形优化’小组；孙小梅，你负责‘丹药副产物活性分析与应用探索’小组……尔等将有机会接触更深奥的理论，并参与宗门实际项目的辅助研究。”
“考核良好与及格者，将继续夯实基础，并可根据自身兴趣与特长，选修‘应用力学’、‘基础材料学’、‘丹房标准化管理’等更具实践性的进阶课程。”
此举最大限度地尊重了弟子们的个体差异，让每个人都能在科学道路上找到适合自己的位置，发挥所长。林妙妙等人眼中迸发出兴奋的光芒，而赵岩、石猛等人也松了口气，至少前路未绝，方向明确。
预备班的阶段性成功，标志着科学修仙的人才培养体系完成了从无到有的突破，具备了规模化、系统化发展的基础。 林枫认为，是时候为其创建一个更正式、更稳固的载体了。
他再次站在了青云殿内，面向青玄真人与四位内核长老。这一次，他带来的是一份关于成立 “青云理学院” 的详细规划。
“宗主，各位长老。”林枫声音沉稳，目光坚定，“科学预备班运行至今，成效卓着，然其偏居一隅，终非长久之计。‘格物致知，科学修仙’之理念，欲要真正融入宗门血脉，成为传承之基，需有独立之机构，系统之章程，明确之地位。弟子恳请，于传功阁之侧，正式设立‘青云理学院’！”
他阐述了理学院的定位与架构：
定位：并非取代传统传功阁，而是与之并列、互补的内核机构。传功阁传授传统功法、法术，是“术”之传承；理学院则探究天地至理，教授科学方法，是“道”之基石与“术”之优化源泉。
架构：设院长一人，由林枫担任，总揽全局。下设“数理”、“物性（含力学、材料）”、“化生（丹道、生物）”三部，由优秀学员或相关长老兼任教习。未来可视情况增设“阵法原理”、“炼器工程”等分部。
职能：系统培养科学修仙人才；进行基础理论与应用技术研究；为宗门各项革新（如阵法、炼丹、炼器、管理）提供理论支持与解决方案。
青玄真人仔细聆听着，目光扫过刑铁、玄云、吴用、墨渊四人。刑铁长老微微颔首，铁山的成功让他对这套理论再无怀疑；玄云真人抚须微笑，乐见其成；吴用长老眼中精光闪铄，已在计算理学院能带来的管理优化效益；就连墨渊长老，也沉默着，没有出言反对。
“准！”青玄真人没有任何尤豫，声音铿锵有力，“即日起，成立‘青云理学院’，林枫任首任院长！宗门资源，一应支持！”
决议迅速落实。传功阁旁，一片原本闲置的偏殿局域被迅速清理、修葺，挂上了由青玄真人亲笔题写的匾额——“青云理学院”！
匾额挂上的那一刻，不仅仅是多了一块牌子，更是标志着“科学修仙”在青云宗，从一个模糊的概念、一小撮人的实践，真正完成了从理念到实体的跨越，成为了宗门官方认可、制度保障的正式组成部分！所有科学小队的成员，以及预备班的学员们，望着那崭新的匾额，心中都涌起一股难以言喻的自豪与激动。
在理学院的第一次高层会议上，林枫向青玄真人与诸位长老展示了更为宏大的未来蓝图。
“理学院之成立，非是终点，而是新的起点。”林枫指向一幅他绘制的宗门发展构想图，“未来，理学院将沿两个主轴并进。”
“其一，深化理论与自身修行。我们将不断探究世界底层规律，完善数理化生体系，并尝试与修炼境界深度融合。弟子之金丹构想，亦需更多理论突破与实践验证。”他目光深邃，显然志存高远。
“其二，体系化培养与全面应用。以理学院为摇篮，系统化、批量化地培养具备科学思维的修仙人才。同时，将科学理念与方法，逐步渗透至宗门管理的方方面面。例如，优化贡献点系统的任务匹配与资源分配算法；创建基于数据的弟子潜力评估与培养路径规划；甚至未来设计更高效、更智能的宗门防御与预警体系……”
他描绘的图景，让在座众人心驰神往。那是一个与传统修仙宗门截然不同的、充满理性光辉与高效秩序的未来。
与此同时，外部合作与内部革新也在同步深化。
炼器堂内，经过墨渊长老与弟子们的不懈努力，结合了灵枢压力阀、感温控火灵阵和计时鸣音符的 “半自动炼丹釜”原型机，终于成功通过测试！当其稳定地炼制出第一炉品质上乘的“回气散”，并且整个过程仅需初期投料和最终收丹，中间环节几乎无需人工干预时，整个丹房都沸腾了！
此物的成功，意味着丹房的生产效率将迎来质的飞跃！对药材，尤其是优质基础药材的须求量必然大增。林枫立刻与吴用长老协调，加大了与百花谷的药材采购订单，并提出了长期、稳定、高质量的供应要求。百花夫人闻讯，喜不自胜，这无疑是巩固双方合作关系的强心剂。
而半自动炼丹釜的制造，涉及精密灵阵刻画与特殊金属加工，对炼器技艺提出了更高要求。墨渊长老在此过程中，全身心投入，不断解决技术难题，将对“工”的极致追求与林枫提供的“理”完美结合，竟在某个深夜，伴随着炼器堂一道冲天的宝光，水到渠成地突破至筑基后期！他出关后，对林枫重重一礼，一切尽在不言中。炼器堂与金石门的合作也因此更加紧密，大量基础金属与粗胚加工订单涌向金石门，乐得石坚门主合不拢嘴。
格物之道，再次以无可辩驳的成果，赢得了宗门高层的由衷赞叹。
然而，就在这一片大好的形势中，林枫收到了一封来自百宝阁钱万通的密信。
信中以隐晦的语言提及：“……中州‘天机院’近年活动频繁，四处探访，似在搜寻具有奇异算理天赋，或持有某些上古机关传承碎片之人……其行事颇为隐秘，目的不明，望林小友稍加留意，或有交集之可能。”
“天机院……搜寻算理天赋与上古机关传承？”林枫放下密信，眼神微凝。这让他立刻联想到了自己的“计算力一号”以及对太初石刻的解析。这二者，似乎都隐隐与“算理”和“上古传承”沾边。是巧合，还是……他感觉到，云遥大陆的水，似乎比他想象的更深。
带着这份警剔与思索，他再次来到了后山矿洞，面对太初石刻。随着他“金丹反应堆”构想的不断完善，以及对世界规律理解的加深，他隐隐感觉，这块神秘的石板似乎与他产生了更深的联系。当他将心神沉入其中，尤其是聚焦于那些涉及能量高度凝聚与时空结构的纹路时，石板深处，仿佛有更加复杂、更加晦涩的纹路在迷雾中若隐若现。他尝试去触碰、理解，却感到神识如同撞上了一堵无形的墙壁，难以深入。
“看来，想要窥探更深层的奥秘，要么需要更强大的神识，要么……需要更庞大的能量去‘激发’。”林枫若有所思。这为他接下来的修行指明了方向——必须尽快提升实力，无论是境界还是神识。
返回居所，林枫在随身笔记的崭新一页上，郑重写下了下一阶段的内核目标：
一、解析金丹并成就金丹！
二、初步接触与了解“天机院”。
他合上笔记，推开窗，望向远方。青云宗内外，气象万千。内部，理学院初立，人才梯队初步成型，丹器两堂革新如火如荼；外部，与百花谷、金石门合作稳固，百宝阁渠道畅通。
林枫的修为，在水到渠成的积累与宗门气运的反哺下，也终于稳稳地迈入了筑基中期。 虽然境界提升不算飞速，但他所拥有的知识体系、对力量的精微掌控、以及在宗门内无可撼动的权威与清淅的未来道路，让他拥有了远超同阶的底蕴与格局。
整个青云宗，如同经过精心淬炼的法器，整体实力稳步提升，凝聚力空前强大。 科学的体系已然初步创建，并拥有了自我更新、持续发展的内核动力。从宗主到杂役，从丹房到炼器堂，从阵法到体修，一种焕然一新的、充满理性与进取精神的宗门气象，已然形成。
星火已然燎原。接下来，便是将这火光，照亮更广阔的天地，乃至……触及那隐藏在星空深处的奥秘。前路依旧挑战重重，但青云宗的巨轮，已然搭载着科学与传统的双翼，蓄势待发，准备驶向更加波澜壮阔的未来。