肃清行动第一天结束，长安城被扣押的普通教民有数千人之众。刘愈把京兆府、六防司以及三司的官员召集起来，做一日后的总结感想，这些官员基本只有一种表示，就是事态之大超出他们的预料。
各牢房才一日已人满为患，各种栽赃举报屡见不鲜，城中居民有得罪人的，生怕被人举报为教徒，落下牢狱之灾。在这年头，进过牢房就好像走一遭阎王殿，百姓心中惧怕，打死都不愿进牢房。
刘愈听了下面的汇报，觉得是时候调整一下战略，把网先收紧。
“明日，将牢房内所关押的普通邪教教徒，登记造册后释放，对一些传教者，仍旧关押，等朝廷进一步指示。”
等官员都离开，刘愈估摸了一下，现在整个长安城中教民数量不在少数，若这次事情处理的不好，会演变成一次大规模的暴动。长安城中也有不少的逆党人员，他们也在等起事的机会。
刘愈回到内廷，本来想好好休息一晚的刘愈，一夜却被打扰了多次。主要因长安城内发生了一点小的动乱。
李糜作为总防司衙门统领，兼兵部尚书，当晚可说是非常紧张来皇宫求见刘愈。刘愈在得知后开始并未理会，觉得城中有小乱也可理解，不过李糜一而再地找人进内廷传话，也让刘愈感觉到问题的紧要性。
连觉都没睡好，刘愈的心情也不佳，等他到了雅前殿。发现除了李糜。还有右相韩升也在。
“到底外面到何等严重的地步？”刘愈看了李糜临时的奏本。并未全信上面所写的内容，到雅前殿里，便劈头盖脸问道。
李糜道：“城中到处有人放火，捣乱，也有盗匪夜间行动，还有趁机杀人抢掠者，长安城内一片风声鹤唳。”
“京兆府……王府尹呢？”刘愈看了下四下，没见王虎的身影。
李糜道：“王府尹在外带着衙差到处奔波。城中尚有火龙队在四下救火，六防司衙门也在帮忙救火，城防懈怠，怕会被外人所趁……”
刘愈毕竟没到皇宫外面去，不知外面混乱到了何等状况。刘愈看了看一边的韩升，问道：“韩相所为何事前来？”
韩升神色凝重道：“四皇子和五皇子母子……今夜被发现死于囚所……”
刘愈先一愣，再转过头看着韩升，惊讶道：“都死了？怎么死的，商量好的？”
韩升无奈摇摇头道：“似是被人所杀。”
刘愈心中有些恼怒，现在乱党的人要刺杀一些朝廷中人。目标却非刘愈和身边的嫡系政要，因为这些人身边保卫紧密。反倒是那些曾经落罪的皇子，因为本身就被看守着，朝廷没去过于理会，才会令其被杀。
“这倒是挺狠毒。”刘愈道，“把几个皇子，还有李贵妃一杀，屎盆子全扣到我身上来了。韩相，你去看看，顺带加强对其他居住在长安城内苏家皇子和公主的保护，务求不能再出半点意外。”
韩升领命，连夜去安排，而李糜仍旧留下，在等刘愈进一步安排。
刘愈让李糜跟着他进雅前殿内，才站定，王虎便在外面求见，刘愈让王虎进来，此时的王虎灰头土脸，像是刚被人抢劫，又掉池塘里刚被捞出来。
“怎么个状况？”刘愈问道。
“先生，您快出去坐镇，学生……学生快撑不住了。”王虎累的够呛，一到雅前殿，身上一股恶臭伴着烧焦的味道，令刘愈觉得刺鼻。
经过王虎的解释，刘愈才大概了解了城中的状况。基本跟李糜说的一样，城中到处都有人在闹事，有教民，也有三教九流跟着闹事的人，烧杀抢掠，整个长安城内都不得安宁。王虎和京兆府几百名衙差，跑断了腿也无法兼顾整个长安城的混乱，只好跟李糜一样跑来找刘愈求助。
“城中戒严情况如何？”刘愈听完王虎的讲述，问道。
“先生，若是戒严有用的话，何至于到如此地步？”王虎一脸颓丧道，“您就快点发威，治治那些暴民，只有如此，京城才不至于混乱。”
王虎对刘愈还算崇拜，他觉得刘愈只要出手，一定能稳定大局。
可现在刘愈除了调军队进城这一途，没别的办法。在调哪支军队上，刘愈思考了一下，长安城两大营因为本身建制问题，并非他嫡系，如今最好是调新军入城。
刘愈马上下达手令，让霍病连夜出城调兵，新军从东门和南门入城，全城戒严。
如此一来，长安城回到了军事高压状态，这也是刘愈赶苏彦下台时候所使用的方法，就是以武力暂时将长安城的混乱压制下来。等军队把守了城中各处街口和要隘，再派京兆府衙差和六防司的士兵挨家挨户去盘查三清教的教徒。
这种军事高压姿态不会像年初一样只持续一个月，在彻底铲除三清教之前，这种状态会一直存在。刘愈也决定，一切政令的实施都配合着武力的行动，同时调一批驻扎在外地的新军入关中，谨防三清教的人利用政治关系图谋篡位。
李糜和王虎听到刘愈所下的命令，便知道长安城风花雪月的好日子到头了，现在朝廷要拿三清教开整，这就好像一场没有兵戈的战争，谁更狠谁就能笑到最后。等刘愈安排完，对王虎喝了一声：“出去办事，没平息好城里的骚乱，连觉也别想睡！”
王虎悻悻然出皇宫，坚守自己的岗位，而李糜则要代表兵部跟刘愈商谈军队入城后的一些安排。
到后半夜，新军开始分批次进城，从东、南两个方向进驻到城里的街口，接替原本京兆府和六防司衙门戒严的职责。
这次负责带兵进城的是霍病，刘愈也是有意如此安排。霍病虽然冲动，但这次军队进城要的就是他这股冲劲，在戒严之后，任何趁着混乱闹事的人，一律可就地格杀，夜晚除非要看病生孩子，又或者有官家路引，否则一切后果，百姓需要自负。
军队一入城，在城中少数地方发生一点小冲突之后，长安城基本也安静下来。军队毕竟不同于京兆府和六防司，军人不惯毛病，拿着人不会往衙门里塞，被抓着的不用问到底是主使还是从犯，一律格杀，只要杀几个，剩下那些也就怕了，出来挑事的浑水摸鱼的一看情况不对，就赶紧散去，就算是回不了家的也赶紧找个地方藏起来，被抓着小命就没了。
到快天明时，刘愈仍旧在雅前殿内等候消息，从各方的反馈来看，长安城中已经大致安定下来。
虽然军队进城能很快平息事态，但后续问题也就跟着产生。等天明后，长安城中居民的普通生活无以为继，朝廷接下来的戒严，会令整个长安城进入长时间的大萧条。
等天命，尚书台的官员，包括韩升、隋妤和柴锦等大小官员到齐，刘愈开了个临时的会议，主要交待了此事。
因为朝廷连番对外开战已经结束，钱粮方面已经不是特别紧张，刘愈准备在城中暂时开放不少的地方为粥场，一者是为赈济困难百姓，再者是为了防止城中因为这次事件而造成普通百姓流离失所。刘愈让隋妤负责此事，严查上下中饱私囊的问题，一定要令长安城中居民能安定下来。
同时，刘愈还准备了一整套的措施，用以防止一些突然情况的发生。在开市交易方面，刘愈沿用了上次全城戒严的经验，在城中几个重要的地点，每日开放一个时辰用来易市，为了防止不法商人对一些日用品囤积居奇，刘愈也让隋妤安排商贸司，在市场上出售平价的日用品，柴米油盐酱醋茶，只要负责好这七件事，城中百姓大致便可安定。
把事情交待好，尚书台的人也赶紧下去安排。隋妤单独留下，跟刘愈商议了一些文武接洽的事宜，因为现在军队入城，长安城中事务很多要以军事为主，朝政也暂时要服从于军事的安排，所以隋妤希望刘愈能开辟一个渠道，令朝廷能跟入城的武将有一定的协调。
“此事我会交给兵部来办理。”刘愈点头道，“你先去做你的，回头会把消息带过去。”
隋妤离开，刘愈没有马上召见过来请见的一批大臣，现在长安城内不管是谁，都在自危，连官员进皇宫打探消息的也不在少数。刘愈先是做了一下人员上安排，把一直在礼部形同赋闲的隋乂，调到兵部去帮李糜的忙，在官职上，刘愈让隋乂暂代兵部侍郎。而他真正的职责，却是负责城中京兆府、商贸司、朝廷及六防司衙门跟进驻长安城军队的沟通，并将一切消息转达到刘愈这里。
等刘愈把隋乂叫来，把差事一安排，隋乂吸口凉气问：“是不是……太复杂了些？”
“没多复杂，你现在的职位紧要，另外我会派一批人手给你，让他们帮你做事。这几天你也用心做事，等事情结束，给你封侯拜相都行。你可要用心了。”
刘愈画出一张很大的饼，虽然是虚无的，但这招对隋乂很好使。隋乂在礼部半年多来闷也快闷死，他是闲不住的那种人，憋了这么久，巴不得大干一场。(